Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms