Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms