Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABPB1Q06547 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms