Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF11Q05519 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms