Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPCQ03188 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms