Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2BQ02880 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms