Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLCB3Q01970 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms