Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNC1Q01954 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms