Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms