Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA4P83105 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA4P83105 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA4P83105 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA4P83105 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA4P83105 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms