Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO4P61968 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO4P61968 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO4P61968 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms