Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEFSECP57772 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EEFSECP57772 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms