Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RIPK4P57078 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIPK4P57078 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms