Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COPAP53621 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COPAP53621 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COPAP53621 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COPAP53621 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
COPAP53621 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPAP53621 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPAP53621 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms