Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACLYP53396 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACLYP53396 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACLYP53396 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACLYP53396 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACLYP53396 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACLYP53396 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms