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Protein–RNA interactions for Protein: P53053
COS12, Protein COS12, yeast
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380 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COS12
P53053
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
0.68
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
MLP1
YKR095W
5628 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.67
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.66
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.66
□□□□□ -2.3
COS12
P53053
BUL2
YML111W
2763 nt
0.65
□□□□□ -2.31
COS12
P53053
BIR1
YJR089W
2865 nt
0.65
□□□□□ -2.31
COS12
P53053
YMR272W-A
YMR272W-A
114 nt
0.62
□□□□□ -2.31
COS12
P53053
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.61
□□□□□ -2.31
COS12
P53053
YNL266W
YNL266W
420 nt
0.6
□□□□□ -2.31
COS12
P53053
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.6
□□□□□ -2.31
COS12
P53053
UTP10
YJL109C
5310 nt
0.58
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
PMP2
YEL017C-A
132 nt
0.58
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.57
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
Q0143
Q0143
153 nt
0.57
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
SEC10
YLR166C
2616 nt
0.55
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
snR69
snR69
101 nt
0.54
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
YJL077W-A
YJL077W-A
87 nt
0.54
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
YBR178W
YBR178W
375 nt
0.54
□□□□□ -2.32
COS12
P53053
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
YOL014W
YOL014W
375 nt
0.52
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
EST1
YLR233C
2100 nt
0.51
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
YBR196C-A
YBR196C-A
150 nt
0.5
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
snR85
snR85
171 nt
0.49
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
75 nt
0.48
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.48
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
RDS3
YPR094W
324 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
IQG1
YPL242C
4488 nt
0.47
□□□□□ -2.33
COS12
P53053
AI1
Q0050
2505 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COS12
P53053
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.45
□□□□□ -2.34
COS12
P53053
YNL103W-A
YNL103W-A
90 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COS12
P53053
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
0.43
□□□□□ -2.34
COS12
P53053
tQ(UUG)Q
tQ(UUG)Q
76 nt
0.42
□□□□□ -2.34
COS12
P53053
snR61
snR61
90 nt
0.41
□□□□□ -2.34
COS12
P53053
MLP2
YIL149C
5040 nt
0.4
□□□□□ -2.35
COS12
P53053
YLR286W-A
YLR286W-A
135 nt
0.38
□□□□□ -2.35
COS12
P53053
YDL159C-B
YDL159C-B
177 nt
0.36
□□□□□ -2.35
COS12
P53053
THO2
YNL139C
4794 nt
0.35
□□□□□ -2.35
COS12
P53053
YGL041C-B
YGL041C-B
183 nt
0.33
□□□□□ -2.36
COS12
P53053
TFB5
YDR079C-A
219 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COS12
P53053
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YAL037C-A
93 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COS12
P53053
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YLR299C-A
93 nt
0.32
□□□□□ -2.36
COS12
P53053
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YOL013W-A
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□□□□□ -2.36
COS12
P53053
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YOL083C-A
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□□□□□ -2.36
COS12
P53053
snR81
snR81
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COS12
P53053
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YER090C-A
90 nt
0.27
□□□□□ -2.37
COS12
P53053
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YNL054W-B
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□□□□□ -2.37
COS12
P53053
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COS12
P53053
snR50
snR50
90 nt
0.24
□□□□□ -2.37
COS12
P53053
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YMR326C
309 nt
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□□□□□ -2.37
COS12
P53053
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YBL071C-B
99 nt
0.22
□□□□□ -2.37
COS12
P53053
SOV1
YMR066W
2697 nt
0.22
□□□□□ -2.37
COS12
P53053
snR128
snR128
126 nt
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□□□□□ -2.38
COS12
P53053
YHR217C
YHR217C
462 nt
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□□□□□ -2.39
COS12
P53053
YBL100W-C
YBL100W-C
120 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COS12
P53053
YBL109W
YBL109W
336 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COS12
P53053
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.15
□□□□□ -2.39
COS12
P53053
YOL164W-A
YOL164W-A
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0.13
□□□□□ -2.39
COS12
P53053
snR67
snR67
82 nt
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□□□□□ -2.39
COS12
P53053
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YML054C-A
159 nt
0.12
□□□□□ -2.39
COS12
P53053
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YHR180C-B
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□□□□□ -2.39
COS12
P53053
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YDR524C-A
120 nt
0.1
□□□□□ -2.39
COS12
P53053
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YML100W-A
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□□□□□ -2.4
COS12
P53053
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YGR240C-A
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□□□□□ -2.4
COS12
P53053
tS(GCU)Q1
tS(GCU)Q1
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0.04
□□□□□ -2.4
COS12
P53053
snR45
snR45
172 nt
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□□□□□ -2.41
COS12
P53053
snR47
snR47
99 nt
0.02
□□□□□ -2.41
COS12
P53053
snR62
snR62
100 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
COS12
P53053
RPL41A
YDL184C
78 nt
-0.06
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COS12
P53053
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YBR109W-A
225 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
COS12
P53053
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YBR296C-A
120 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
COS12
P53053
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
COS12
P53053
PAU9
YBL108C-A
129 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
COS12
P53053
YDL247W-A
YDL247W-A
75 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
COS12
P53053
SKI7
YOR076C
2244 nt
-0.15
□□□□□ -2.43
COS12
P53053
SBH2
YER019C-A
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□□□□□ -2.44
COS12
P53053
YLL066W-B
YLL066W-B
171 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
COS12
P53053
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.22
□□□□□ -2.44
COS12
P53053
snR38
snR38
95 nt
-0.22
□□□□□ -2.44
COS12
P53053
YKL225W
YKL225W
348 nt
-0.25
□□□□□ -2.45
COS12
P53053
YKL106C-A
YKL106C-A
120 nt
-0.36
□□□□□ -2.47
COS12
P53053
snR64
snR64
101 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
COS12
P53053
YOR376W-A
YOR376W-A
156 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
COS12
P53053
snR161
snR161
161 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
COS12
P53053
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
COS12
P53053
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
COS12
P53053
YOR316C-A
YOR316C-A
210 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
COS12
P53053
snR53
snR53
91 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
COS12
P53053
YDL159W-A
YDL159W-A
132 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
COS12
P53053
YGR122C-A
YGR122C-A
129 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
COS12
P53053
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
COS12
P53053
snR33
snR33
183 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
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