Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

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Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.71□□□□□ -2.14
MSN5P52918 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.71□□□□□ -2.14
MSN5P52918 RDS3YPR094W 324 nt1.71□□□□□ -2.14
MSN5P52918 snR38snR38 95 nt1.68□□□□□ -2.14
MSN5P52918 CDC39YCR093W 6327 nt1.68□□□□□ -2.14
MSN5P52918 BST1YFL025C 3090 nt1.67□□□□□ -2.14
MSN5P52918 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.66□□□□□ -2.14
MSN5P52918 SPC110YDR356W 2835 nt1.66□□□□□ -2.14
MSN5P52918 MSN5YDR335W 3675 nt1.64□□□□□ -2.15
MSN5P52918 snR75snR75 89 nt1.64□□□□□ -2.15
MSN5P52918 IRA1YBR140C 9279 nt1.63□□□□□ -2.15
MSN5P52918 SKI7YOR076C 2244 nt1.63□□□□□ -2.15
MSN5P52918 AI1Q0050 2505 nt1.63□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.61□□□□□ -2.15
MSN5P52918 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.59□□□□□ -2.16
MSN5P52918 NIP1YMR309C 2439 nt1.59□□□□□ -2.16
MSN5P52918 EST2YLR318W 2655 nt1.58□□□□□ -2.16
MSN5P52918 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.58□□□□□ -2.16
MSN5P52918 FYV8YGR196C 2454 nt1.58□□□□□ -2.16
MSN5P52918 SIP4YJL089W 2490 nt1.57□□□□□ -2.16
MSN5P52918 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.56□□□□□ -2.16
MSN5P52918 BUL2YML111W 2763 nt1.56□□□□□ -2.16
MSN5P52918 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.56□□□□□ -2.16
MSN5P52918 NST1YNL091W 3723 nt1.55□□□□□ -2.16
MSN5P52918 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.55□□□□□ -2.16
MSN5P52918 HKR1YDR420W 5409 nt1.53□□□□□ -2.16
MSN5P52918 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
MSN5P52918 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.52□□□□□ -2.17
MSN5P52918 MYO1YHR023W 5787 nt1.48□□□□□ -2.17
MSN5P52918 SPT7YBR081C 3999 nt1.47□□□□□ -2.17
MSN5P52918 YOL014WYOL014W 375 nt1.41□□□□□ -2.18
MSN5P52918 UTP20YBL004W 7482 nt1.4□□□□□ -2.18
MSN5P52918 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.38□□□□□ -2.19
MSN5P52918 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.37□□□□□ -2.19
MSN5P52918 DOP1YDR141C 5097 nt1.36□□□□□ -2.19
MSN5P52918 BUD3YCL014W 4911 nt1.34□□□□□ -2.2
MSN5P52918 RKR1YMR247C 4689 nt1.32□□□□□ -2.2
MSN5P52918 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.32□□□□□ -2.2
MSN5P52918 PET111YMR257C 2403 nt1.31□□□□□ -2.2
MSN5P52918 snR67snR67 82 nt1.23□□□□□ -2.21
MSN5P52918 VAM6YDL077C 3150 nt1.21□□□□□ -2.22
MSN5P52918 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.19□□□□□ -2.22
MSN5P52918 YMR160WYMR160W 2451 nt1.17□□□□□ -2.22
MSN5P52918 YPR117WYPR117W 7470 nt1.16□□□□□ -2.22
MSN5P52918 SCC2YDR180W 4482 nt1.12□□□□□ -2.23
MSN5P52918 BEM2YER155C 6504 nt1.1□□□□□ -2.23
MSN5P52918 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.08□□□□□ -2.24
MSN5P52918 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.08□□□□□ -2.24
MSN5P52918 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.08□□□□□ -2.24
MSN5P52918 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.08□□□□□ -2.24
MSN5P52918 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.08□□□□□ -2.24
MSN5P52918 LTE1YAL024C 4308 nt1.06□□□□□ -2.24
MSN5P52918 YJR029WYJR029W 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
MSN5P52918 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
MSN5P52918 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.06□□□□□ -2.24
MSN5P52918 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.06□□□□□ -2.24
MSN5P52918 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.99□□□□□ -2.25
MSN5P52918 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.97□□□□□ -2.25
MSN5P52918 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.91□□□□□ -2.26
MSN5P52918 MLP2YIL149C 5040 nt0.91□□□□□ -2.26
MSN5P52918 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
MSN5P52918 MLP1YKR095W 5628 nt0.83□□□□□ -2.28
MSN5P52918 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.8□□□□□ -2.28
MSN5P52918 FMP27YLR454W 7887 nt0.79□□□□□ -2.28
MSN5P52918 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.78□□□□□ -2.28
MSN5P52918 THO2YNL139C 4794 nt0.77□□□□□ -2.29
MSN5P52918 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.75□□□□□ -2.29
MSN5P52918 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
MSN5P52918 snR40snR40 97 nt0.72□□□□□ -2.29
MSN5P52918 IQG1YPL242C 4488 nt0.71□□□□□ -2.3
MSN5P52918 UTP10YJL109C 5310 nt0.7□□□□□ -2.3
MSN5P52918 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.7□□□□□ -2.3
MSN5P52918 snR77snR77 88 nt0.69□□□□□ -2.3
MSN5P52918 SBH2YER019C-A 267 nt0.62□□□□□ -2.31
MSN5P52918 SOV1YMR066W 2697 nt0.6□□□□□ -2.31
MSN5P52918 PAU9YBL108C-A 129 nt0.54□□□□□ -2.32
MSN5P52918 snR128snR128 126 nt0.5□□□□□ -2.33
MSN5P52918 ESP1YGR098C 4893 nt0.5□□□□□ -2.33
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