Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA5P52803 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA5P52803 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms