Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP4P49662 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP4P49662 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP4P49662 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP4P49662 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms