Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms