Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTPAP49638 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTPAP49638 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTPAP49638 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TTPAP49638 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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TTPAP49638 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TTPAP49638 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TTPAP49638 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TTPAP49638 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TTPAP49638 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTPAP49638 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTPAP49638 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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