Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NESP48681 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NESP48681 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NESP48681 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NESP48681 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NESP48681 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NESP48681 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NESP48681 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NESP48681 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NESP48681 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NESP48681 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NESP48681 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NESP48681 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NESP48681 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
NESP48681 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NESP48681 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms