Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UTRNP46939 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UTRNP46939 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTRNP46939 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTRNP46939 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTRNP46939 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UTRNP46939 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTRNP46939 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTRNP46939 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UTRNP46939 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UTRNP46939 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UTRNP46939 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UTRNP46939 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UTRNP46939 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms