Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.47□□□□□ -2.48
SOK1P40317 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.48□□□□□ -2.49
SOK1P40317 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
SOK1P40317 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
SOK1P40317 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
SOK1P40317 YOR170WYOR170W 306 nt-0.48□□□□□ -2.49
SOK1P40317 YOR302WYOR302W 78 nt-0.48□□□□□ -2.49
SOK1P40317 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.48□□□□□ -2.49
SOK1P40317 snR56snR56 88 nt-0.49□□□□□ -2.49
SOK1P40317 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.49□□□□□ -2.49
SOK1P40317 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.49□□□□□ -2.49
SOK1P40317 snR65snR65 100 nt-0.5□□□□□ -2.49
SOK1P40317 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.5□□□□□ -2.49
SOK1P40317 snR39BsnR39B 96 nt-0.5□□□□□ -2.49
SOK1P40317 URB1YKL014C 5295 nt-0.51□□□□□ -2.49
SOK1P40317 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.53□□□□□ -2.49
SOK1P40317 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.54□□□□□ -2.5
SOK1P40317 YNL266WYNL266W 420 nt-0.54□□□□□ -2.5
SOK1P40317 snR161snR161 161 nt-0.54□□□□□ -2.5
SOK1P40317 snR50snR50 90 nt-0.54□□□□□ -2.5
SOK1P40317 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.55□□□□□ -2.5
SOK1P40317 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.55□□□□□ -2.5
SOK1P40317 JLP2YMR132C 627 nt-0.57□□□□□ -2.5
SOK1P40317 RDS3YPR094W 324 nt-0.57□□□□□ -2.5
SOK1P40317 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
SOK1P40317 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.59□□□□□ -2.5
SOK1P40317 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.61□□□□□ -2.51
SOK1P40317 snR80snR80 171 nt-0.62□□□□□ -2.51
SOK1P40317 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.63□□□□□ -2.51
SOK1P40317 snR52snR52 92 nt-0.64□□□□□ -2.51
SOK1P40317 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.65□□□□□ -2.51
SOK1P40317 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.65□□□□□ -2.51
SOK1P40317 snR48snR48 113 nt-0.65□□□□□ -2.51
SOK1P40317 YBR178WYBR178W 375 nt-0.66□□□□□ -2.52
SOK1P40317 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.68□□□□□ -2.52
SOK1P40317 YNL205CYNL205C 423 nt-0.7□□□□□ -2.52
SOK1P40317 snR67snR67 82 nt-0.71□□□□□ -2.52
SOK1P40317 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.71□□□□□ -2.52
SOK1P40317 SKI7YOR076C 2244 nt-0.71□□□□□ -2.52
SOK1P40317 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.71□□□□□ -2.52
SOK1P40317 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.73□□□□□ -2.53
SOK1P40317 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.75□□□□□ -2.53
SOK1P40317 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.77□□□□□ -2.53
SOK1P40317 YOR102WYOR102W 351 nt-0.77□□□□□ -2.53
SOK1P40317 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
SOK1P40317 YNL198CYNL198C 303 nt-0.83□□□□□ -2.54
SOK1P40317 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.84□□□□□ -2.54
SOK1P40317 YBL053WYBL053W 375 nt-0.85□□□□□ -2.55
SOK1P40317 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.85□□□□□ -2.55
SOK1P40317 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.86□□□□□ -2.55
SOK1P40317 YJL150WYJL150W 303 nt-0.88□□□□□ -2.55
SOK1P40317 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.89□□□□□ -2.55
SOK1P40317 YNR077CYNR077C 255 nt-0.93□□□□□ -2.56
SOK1P40317 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.99□□□□□ -2.57
SOK1P40317 snR77snR77 88 nt-1□□□□□ -2.57
SOK1P40317 Q0142Q0142 177 nt-1□□□□□ -2.57
SOK1P40317 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.02□□□□□ -2.57
SOK1P40317 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.02□□□□□ -2.57
SOK1P40317 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.02□□□□□ -2.57
SOK1P40317 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.05□□□□□ -2.58
SOK1P40317 SPG3YDR504C 384 nt-1.06□□□□□ -2.58
SOK1P40317 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.06□□□□□ -2.58
SOK1P40317 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.06□□□□□ -2.58
SOK1P40317 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.07□□□□□ -2.58
SOK1P40317 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.15□□□□□ -2.59
SOK1P40317 YGR151CYGR151C 336 nt-1.17□□□□□ -2.6
SOK1P40317 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.17□□□□□ -2.6
SOK1P40317 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.18□□□□□ -2.6
SOK1P40317 snR81snR81 201 nt-1.19□□□□□ -2.6
SOK1P40317 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.19□□□□□ -2.6
SOK1P40317 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.19□□□□□ -2.6
SOK1P40317 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.2□□□□□ -2.6
SOK1P40317 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.21□□□□□ -2.6
SOK1P40317 snR38snR38 95 nt-1.22□□□□□ -2.6
SOK1P40317 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.22□□□□□ -2.6
SOK1P40317 RPL41AYDL184C 78 nt-1.23□□□□□ -2.61
SOK1P40317 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.23□□□□□ -2.61
SOK1P40317 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.23□□□□□ -2.61
SOK1P40317 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.28□□□□□ -2.61
SOK1P40317 YNL338WYNL338W 159 nt-1.29□□□□□ -2.62
SOK1P40317 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.33□□□□□ -2.62
SOK1P40317 snR47snR47 99 nt-1.33□□□□□ -2.62
SOK1P40317 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.34□□□□□ -2.62
SOK1P40317 YOR309CYOR309C 381 nt-1.37□□□□□ -2.63
SOK1P40317 YNL337WYNL337W 255 nt-1.43□□□□□ -2.64
SOK1P40317 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.45□□□□□ -2.64
SOK1P40317 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.47□□□□□ -2.64
SOK1P40317 snR6snR6 112 nt-1.5□□□□□ -2.65
SOK1P40317 YKL225WYKL225W 348 nt-1.53□□□□□ -2.65
SOK1P40317 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.58□□□□□ -2.66
SOK1P40317 Q0032Q0032 291 nt-1.6□□□□□ -2.67
SOK1P40317 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.6□□□□□ -2.67
SOK1P40317 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.62□□□□□ -2.67
SOK1P40317 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.63□□□□□ -2.67
SOK1P40317 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.63□□□□□ -2.67
SOK1P40317 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.64□□□□□ -2.67
SOK1P40317 YDR543CYDR543C 300 nt-1.64□□□□□ -2.67
SOK1P40317 snR73snR73 106 nt-1.65□□□□□ -2.67
SOK1P40317 snR61snR61 90 nt-1.68□□□□□ -2.68
SOK1P40317 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.68□□□□□ -2.68
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