Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK1P39086 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK1P39086 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms