Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL4P36578 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL4P36578 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL4P36578 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL4P36578 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL4P36578 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL4P36578 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL4P36578 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms