Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms