Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1E1P36543 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1E1P36543 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms