Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDIT3P35638 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms