Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN2P35609 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms