Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP6P35125 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP6P35125 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP6P35125 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP6P35125 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP6P35125 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms