Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P33897 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCD1P33897 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms