Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC1P33527 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC1P33527 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms