Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 snR80snR80 171 nt-0.18□□□□□ -2.44
MSK1P32048 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.19□□□□□ -2.44
MSK1P32048 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.23□□□□□ -2.45
MSK1P32048 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.28□□□□□ -2.45
MSK1P32048 snR52snR52 92 nt-0.3□□□□□ -2.46
MSK1P32048 SEC10YLR166C 2616 nt-0.31□□□□□ -2.46
MSK1P32048 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.31□□□□□ -2.46
MSK1P32048 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.31□□□□□ -2.46
MSK1P32048 snR39BsnR39B 96 nt-0.31□□□□□ -2.46
MSK1P32048 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.32□□□□□ -2.46
MSK1P32048 SBH2YER019C-A 267 nt-0.33□□□□□ -2.46
MSK1P32048 snR69snR69 101 nt-0.36□□□□□ -2.47
MSK1P32048 snR48snR48 113 nt-0.36□□□□□ -2.47
MSK1P32048 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.4□□□□□ -2.47
MSK1P32048 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.42□□□□□ -2.48
MSK1P32048 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.43□□□□□ -2.48
MSK1P32048 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.43□□□□□ -2.48
MSK1P32048 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.46□□□□□ -2.48
MSK1P32048 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.46□□□□□ -2.48
MSK1P32048 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.46□□□□□ -2.48
MSK1P32048 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.46□□□□□ -2.48
MSK1P32048 snR161snR161 161 nt-0.46□□□□□ -2.48
MSK1P32048 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.47□□□□□ -2.48
MSK1P32048 RDS3YPR094W 324 nt-0.47□□□□□ -2.48
MSK1P32048 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.49□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.49□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.49□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.52□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YNL205CYNL205C 423 nt-0.52□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YOR102WYOR102W 351 nt-0.52□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.52□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YNR077CYNR077C 255 nt-0.53□□□□□ -2.49
MSK1P32048 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.55□□□□□ -2.5
MSK1P32048 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.57□□□□□ -2.5
MSK1P32048 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.57□□□□□ -2.5
MSK1P32048 YJL150WYJL150W 303 nt-0.58□□□□□ -2.5
MSK1P32048 snR50snR50 90 nt-0.58□□□□□ -2.5
MSK1P32048 URB1YKL014C 5295 nt-0.58□□□□□ -2.5
MSK1P32048 YNL266WYNL266W 420 nt-0.59□□□□□ -2.5
MSK1P32048 JLP2YMR132C 627 nt-0.6□□□□□ -2.51
MSK1P32048 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.6□□□□□ -2.51
MSK1P32048 snR33snR33 183 nt-0.62□□□□□ -2.51
MSK1P32048 SPG3YDR504C 384 nt-0.63□□□□□ -2.51
MSK1P32048 YBR178WYBR178W 375 nt-0.64□□□□□ -2.51
MSK1P32048 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.65□□□□□ -2.51
MSK1P32048 YNL198CYNL198C 303 nt-0.65□□□□□ -2.51
MSK1P32048 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.67□□□□□ -2.52
MSK1P32048 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.7□□□□□ -2.52
MSK1P32048 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.71□□□□□ -2.52
MSK1P32048 snR67snR67 82 nt-0.74□□□□□ -2.53
MSK1P32048 YBL053WYBL053W 375 nt-0.75□□□□□ -2.53
MSK1P32048 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.79□□□□□ -2.54
MSK1P32048 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.8□□□□□ -2.54
MSK1P32048 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.83□□□□□ -2.54
MSK1P32048 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.85□□□□□ -2.55
MSK1P32048 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
MSK1P32048 SKI7YOR076C 2244 nt-0.89□□□□□ -2.55
MSK1P32048 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.9□□□□□ -2.55
MSK1P32048 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.92□□□□□ -2.56
MSK1P32048 YGR151CYGR151C 336 nt-0.96□□□□□ -2.56
MSK1P32048 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.04□□□□□ -2.58
MSK1P32048 YNL338WYNL338W 159 nt-1.07□□□□□ -2.58
MSK1P32048 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.1□□□□□ -2.59
MSK1P32048 YNL337WYNL337W 255 nt-1.15□□□□□ -2.59
MSK1P32048 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.15□□□□□ -2.59
MSK1P32048 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.19□□□□□ -2.6
MSK1P32048 snR77snR77 88 nt-1.21□□□□□ -2.6
MSK1P32048 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.21□□□□□ -2.6
MSK1P32048 Q0032Q0032 291 nt-1.23□□□□□ -2.61
MSK1P32048 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.29□□□□□ -2.62
MSK1P32048 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.32□□□□□ -2.62
MSK1P32048 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.32□□□□□ -2.62
MSK1P32048 snR81snR81 201 nt-1.33□□□□□ -2.62
MSK1P32048 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.33□□□□□ -2.62
MSK1P32048 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.33□□□□□ -2.62
MSK1P32048 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.34□□□□□ -2.62
MSK1P32048 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.37□□□□□ -2.63
MSK1P32048 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.37□□□□□ -2.63
MSK1P32048 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.37□□□□□ -2.63
MSK1P32048 RPL41AYDL184C 78 nt-1.38□□□□□ -2.63
MSK1P32048 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.4□□□□□ -2.63
MSK1P32048 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.42□□□□□ -2.64
MSK1P32048 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.46□□□□□ -2.64
MSK1P32048 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.47□□□□□ -2.64
MSK1P32048 YDR543CYDR543C 300 nt-1.48□□□□□ -2.65
MSK1P32048 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.48□□□□□ -2.65
MSK1P32048 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.51□□□□□ -2.65
MSK1P32048 YOR309CYOR309C 381 nt-1.51□□□□□ -2.65
MSK1P32048 snR38snR38 95 nt-1.51□□□□□ -2.65
MSK1P32048 snR47snR47 99 nt-1.54□□□□□ -2.66
MSK1P32048 YLR294CYLR294C 330 nt-1.64□□□□□ -2.67
MSK1P32048 YOR225WYOR225W 330 nt-1.64□□□□□ -2.67
MSK1P32048 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.72□□□□□ -2.68
MSK1P32048 snR61snR61 90 nt-1.74□□□□□ -2.69
MSK1P32048 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.74□□□□□ -2.69
MSK1P32048 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.78□□□□□ -2.69
MSK1P32048 YKL225WYKL225W 348 nt-1.8□□□□□ -2.7
MSK1P32048 YNL170WYNL170W 396 nt-1.8□□□□□ -2.7
MSK1P32048 snR6snR6 112 nt-1.86□□□□□ -2.71
MSK1P32048 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.93□□□□□ -2.72
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