Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC27P30260 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC27P30260 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC27P30260 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC27P30260 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC27P30260 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC27P30260 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC27P30260 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms