Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP1P29466 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP1P29466 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP1P29466 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP1P29466 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms