Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHC1P29353 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHC1P29353 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHC1P29353 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHC1P29353 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHC1P29353 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHC1P29353 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHC1P29353 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms