Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCAP28676 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCAP28676 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GCAP28676 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GCAP28676 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCAP28676 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCAP28676 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCAP28676 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms