Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms