Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTSSP25774 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTSSP25774 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms