Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5A1P25705 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5A1P25705 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms