Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA6P23229 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA6P23229 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms