Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms