Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms