Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD58P19256 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD58P19256 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD58P19256 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD58P19256 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD58P19256 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD58P19256 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD58P19256 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD58P19256 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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