Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF3P18847 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF3P18847 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF3P18847 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ATF3P18847 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF3P18847 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATF3P18847 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF3P18847 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATF3P18847 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF3P18847 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms