Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL17P18621 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL17P18621 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL17P18621 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL17P18621 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL17P18621 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL17P18621 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL17P18621 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL17P18621 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL17P18621 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL17P18621 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL17P18621 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms