Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EGR1P18146 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EGR1P18146 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms