Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD1P17405 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms