Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF35P13682 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms